高速冷凍離心機在運行過程中，如果操作的不好的話，如升壓速度過快，就會導致離心機流道梗塞，從而導致部份截面變小。注意事項：
1.臺式高速冷凍離心機在預冷狀態時，離心機蓋必須關閉，離心結束后取出轉頭要倒置于實驗臺上，擦干腔內余水，離心機蓋處于打開狀態。
2.超速離心時，液體一定要加滿離心管，應超離時需抽真空，只有加滿才能避免離心管變形。如離心管蓋子密封性差液體就不能加滿，以防外溢，影響感應器正常工作。
3.轉頭在預冷時轉頭蓋可擺放在離心機的平臺上，或擺放在實驗臺上，千萬不可不擰緊浮放在轉頭上，因為一旦誤啟動，轉頭蓋就會飛出，造成事故！
4.轉頭蓋在擰緊后一定要用手指觸摸轉頭與轉蓋之間有無縫隙，如有縫隙要擰開重新擰緊，直至確認無縫隙方可啟動離心機。
5.使用時一定要接地線。離心管內所加的物質應相對平衡，如引起兩邊不平衡，會對離心機成很大的損傷，至少將縮短離心機的使用壽命。
6.在離心過程中，操作人員不得離開離心機室，一旦發生異常情況操作人員不能關電源（POWER），要按STOP。在預冷前要填寫好離心機使用記錄。
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